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JBits由一系列的Java类库组成，可以控制位流配置数据的产生，并提供了能够直接访问Xilinx Virtex-II（tm） FPGA芯片位流结构文件的应用程序接口（API）。API可以用来构建能够在Xilinx Virtex-II FPGA芯片内部执行的数字电路设计和参数核
同时API还提供了对Virtex-II结构的最底层的接口，因此它也能充当基础来构造传统电路的布局和布线，并且应用针对性的工具来完成更为精细的规定任务。JBits程序流程包括以下步骤，首先创建一个JBits对象，然后输入配置位流到JBits对象，再根据设计数据改变配置位流，最后输出设计的配置位流。JBits可单独使用，也可用作开发其他工具的基础。JBits3.0版本支持Virtex-Ⅱ系列芯片，允许对该系列的FPGA芯片中所有的可设置参数进行编程存取。
Xilinx公司开发的一个应用程序接口，它既能够直接操作由相关CAD工具生成的配置位流文件，又能够操作从FPGA上读回的配置位流文件，通过直接修改FPGA逻辑资源（例如LUT、布线资源、触发器等）的配置信息来实现系统功能重构。尽管能用JBits在FPGA实现所有的逻辑功能，但由于FPGA器件结构很复杂，一般不直接采用JBits来设计一个应用模块。在动态可重构系统中，可以先用CAD工具生成多个应用模块的整体配置文件，然后通过JBits来比较后续配置文件与初始配置文件的差异，生成对应于该后续配置的部分可重构配置文件，用该部分可重构配置文件对FPGA进行配置，就可以使FPGA从初始配置转换到后续配置。JBits最大的缺陷在于它完全依赖于使用者的人工设计，包括布线资源如何的连接，这就要求使用者对FPGA的结构细节非常熟悉，因此，设计难度较大。另外，JBits在当前只支持Virtex、Virtex一n系列FPGA，尚不能支持Virtex一4、Virtex一5系列等更高级的FPGA。
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